J Comput biol: kaedah baru untuk meramal sasaran ubat antivirus atau vaksin

Kaedah baru untuk meramalkan ubat-ubatan antivirus yang paling menjanjikan atau sasaran vaksin adalah berdasarkan perubahan conformational yang dialami oleh viral glycoprotein semasa pengiktirafan dan mengikat ke sel tuan rumah. Kaedah ramalan ini adalah bertujuan untuk rantai hidrogen bon utama motif tenaga bebas yang tertinggi. Keputusan penyelidikan yang berkaitan diterbitkan dalam jurnal biologi Komputeran, yang merupakan jurnal yang disemak semula yang diterbitkan oleh Mary Ann Liebert.

Robert Penner adalah Pengerusi Rene Thom dari Institut pengajian tinggi Perancis (Bures-sur-Yvette) dan biologi matematik UCLA. Beliau adalah pengarang artikel ini bertajuk "penganggar-tulang belakang tenaga bebas digunakan untuk viral Glycoprotein"

Imej sumber: Mary Ann Liebert, Inc., penerbit

Sebagai virus memasuki sel tuan rumah dan diserap, virus biasanya terkurang berat, membentuk motif fusion/inpenurasan. Penner mencadangkan kaedah umum untuk meramalkan sisa aktif yang sangat telus daripada struktur tiga dimensi viral glycoprotein. Kaedah ini termasuk menganalisis bon hidrogen protein dan mengira perbezaan tenaga bebas daripada ciri yang sepadan untuk menentukan kawasan di mana perubahan konformasi yang paling mungkin berlaku. Kaedah yang dicadangkan dalam kertas kerja ini kini digunakan untuk Spike glycoprotin SARS CoV-2, yang boleh menyebabkan COVID-19.

Misha Gromov Institut Sains termaju dan Universiti New York berkata: "idea matematik secara langsung membawa kepada makna yang praktikal, yang semata-mata keajaiban, tetapi ganjaran adalah besar kerana ia berlaku dalam teori bidang elektromagnet Maxwell-ia membawa radio dan televisyen, membuka pintu untuk pengiraan teori dalam dunia digital kami." Beliau adalah ahli matematik terkenal dan pemenang Hadiah Abel (juga dikenali sebagai Hadiah Nobel dalam matematik). "Hanya apabila pengarang adalah ahli matematik yang cemerlang tetapi juga mempunyai satu Horizon saintifik yang luas, apa-apa idea yang mungkin, dan ini adalah jarang berlaku di kalangan ahli matematik terbaik dari masa kita. Robert Penner ialah ahli matematik yang jarang berlaku, beliau mendapati bahawa kaedah corak struktur protein adalah berbeza daripada orang lain di dunia, dan corak struktur protein adalah hasil daripada pemikiran matematik tulen. Kaedah ini mungkin memainkan peranan dan mempercepatkan pembangunan ubat anti-virus atau vaksin. Tetapi hanya percubaan boleh membuktikan ini. "(Bioon.com)

Sumber: